El cloro es el desinfectante de uso más común en todo el mundo. AySA emplea cloro gaseoso en las plantas potabilizadoras Gral. San Martín y Gral. Belgrano, almacenado en forma líquida bajo presión, que resulta especialmente apto para instalaciones de gran envergadura.

La importancia y la eficacia de la desinfección con cloro es incuestionable, a la hora de suministrar agua segura para beber. Pese a esto, pueden aparecer efectos indeseables como olores y/o sabores. La O.M.S. recomienda no sobrepasar el límite de los 5 mg/l de cloro residual libre.

La utilización de cualquier tipo de desinfectante puede traer aparejada la formación de subproductos indeseados al combinarse con otras sustancias presentes en el agua. Sin embargo, los riesgos potenciales que presentan para la salud los subproductos de la cloración, no pueden compararse con los inherentes a una desinfección insuficiente.